3. Ön Eleme turunda MTK Budapeşte ile eşleşmiştik. İlk maçı evimizde 2-0 , ikinci maçıda deplasmanda 5-0 kazanmıştık . Play -of turunda ise Partizan ile eşleşmiştik . İlk maçta deplasmanda 2-2 berabere kalmıştık , ikinci maçı da evimizde 2-1 kazanmıştık. Grupta ise 2 puanla sonuncu olmuştuk .
Porto 3-1Fenerbahçe ( 17 Eylül 2008)
Fenerbahçe 0-0 Dynamo Kiev ( 30 Eylül 2008)
Fenerbahçe 2-5 Arsenal ( 21 Ekim 2008)
Arsenal 0-0 Fenerbahçe ( 5 Kasım 2008)
Fenerbahçe 1-2 Porto ( 25 Kasım 2008)
Dynamo Kiev 1-0 Fenerbahçe ( 10 Aralık 2008)
Porto 3-1Fenerbahçe ( 17 Eylül 2008)
Fenerbahçe 0-0 Dynamo Kiev ( 30 Eylül 2008)
Fenerbahçe 2-5 Arsenal ( 21 Ekim 2008)
Arsenal 0-0 Fenerbahçe ( 5 Kasım 2008)
Fenerbahçe 1-2 Porto ( 25 Kasım 2008)
Dynamo Kiev 1-0 Fenerbahçe ( 10 Aralık 2008)